Немецкие учёные из Гёттингенского университета разработали устойчивый к экстремальным погодным условиям сорт кукурузы по новой технологии сенквенирования ДНК. Об этом пишет журнал PLoS Genetics.
Метод сенквенирования ДНК известен ещё с 2003 года. Хотя с тех пор эта процедура стала намного дешевле, сбор полной генетической информации о сельхозкультурах по-прежнему требует больших финансовых и технических затрат. Однако исследователи смогли решить эту проблему. Они предлагают сенквенировать лишь небольшую случайную часть генома, а оставшиеся данные исследовать с помощью математических и статистических методов.
Подробнее о методе рассказал главный автор исследования, доктор Торстен Пок из принадлежащего вузу Центра комплексных исследований в области селекции. По его словам, суть в распознании «блоков гаплотипов» (длинных участков генома, которые похожи у разных растений из-за наследования) и использовании их мозаичной структуры для сбора остальных данных. Исследователь отметил, что качество генетических последовательностей при этой технологии сравнимо со сбором в 100 раз большего объёма информации из цепи ДНК.
Сейчас в рамках проекта MAZE учёные пытаются вывести по новой технологии кукурузу с низкой чувствительностью к засухе и заморозкам. В качестве партнёра в проекте выступила компания KWS Saat SE, которая начала использовать этот метод в своих селекционных программах. К сожалению, пока основным недостатком технологии является возможность её использования только для инбредных генетических линий (полученных при инбриндинге, то есть скрещивании родственных особей). В связи с этим учёные хотят усовершенствовать её для возможности использовать на организмах с обычным двойным набором хромосом. Это позволит использовать метод для человека и многих других позвоночных.